Sebilangan besar bayi yang mengandung IVF tidak mengalami kecacatan kelahiran.[12] Walau bagaimanapun, beberapa kajian menunjukkan bahawa teknologi pembiakan yang dibantu dikaitkan dengan peningkatan risiko kecacatan kelahiran.[13][14] Teknologi pembiakan buatan semakin tersedia. Kajian awal menunjukkan bahawa mungkin terdapat peningkatan risiko komplikasi perubatan dengan ibu dan bayi. Beberapa di antaranya termasuk berat lahir rendah, kekurangan plasenta, gangguan kromosom, kelahiran prematur, diabetes kehamilan, dan praeklampsia (Aiken dan Brockelsby).[15]

Dalam kajian AS yang terbesar, menggunakan data dari daftar kecacatan kelahiran di seluruh negara,[16] 6.2% kanak-kanak yang dikandung IVF mempunyai kecacatan besar, berbanding dengan 4.4% anak yang mengandung secara semula jadi sesuai dengan usia ibu dan faktor lain (nisbah peluang, 1.3; selang keyakinan 95%, 1.00 hingga 1.67).[12] ART membawa risiko risiko kehamilan heterotopik (kehamilan intrauterin dan ekstrauterin serentak).[17] Risiko utama adalah:

• Gangguan genetik
• Berat lahir rendah.[18] Dalam IVF dan ICSI, faktor risiko adalah penurunan ekspresi protein dalam metabolisme tenaga; Rantai ringan Ferritin dan ATP5A1.[19]
• Kelahiran pramatang. Berat lahir rendah dan kelahiran pramatang sangat berkaitan dengan banyak masalah kesihatan, seperti masalah penglihatan dan palsi serebrum. Kanak-kanak yang dilahirkan selepas IVF kira-kira dua kali lebih mungkin mengalami palso serebrum.[20]

Derma sperma adalah pengecualian, dengan kadar kecacatan kelahiran hampir seperlima berbanding dengan populasi umum. Ini dapat dijelaskan oleh bahawa bank sperma hanya menerima orang dengan jumlah sperma yang tinggi.

Data semasa menunjukkan sedikit atau tidak ada peningkatan risiko kemurungan postpartum di kalangan wanita yang menggunakan ART.[21]

Penggunaan teknologi pembiakan yang dibantu termasuk rangsangan ovari dan persenyawaan in vitro telah dikaitkan dengan peningkatan risiko keseluruhan kanser kanak-kanak pada keturunan, yang mungkin disebabkan oleh penyakit atau keadaan asal yang sama yang menyebabkan kemandulan atau subkesuburan pada ibu atau ayah.[22]

Oleh itu, dalam makalah terkenal oleh Jacques Balayla dll. ditentukan bahawa bayi yang dilahirkan setelah ART mempunyai perkembangan saraf yang serupa dengan bayi yang dilahirkan setelah semula jadi.[23]